Основное внимание уделялось вопросам внутренней «безопасности». В первое время все усилия Ш отделения были направлены главным образом на предотвращение последствий восстания декабристов. Возросла цензурная опека за периодическими изданиями, литературой и театральными представлениями. Одновременно с этим, были сделаны первые шаги к подчинению своему влиянию иностранной прессы (в этом плане определенная роль отводилась агентам-литераторам).

Отчеты Ш отделения 40-х годов иллюстрируют весь ход борьбы органа полиции с возросшим общественно-политическим движением в стране. Наибольшую угрозу «общественному порядку», по мнению Ш отделения, представляли: активизация деятельности передовых журналов («Отечественные записки», «Современник»), возрастание студенческого движения на Украине, где с конца 1845 года и до начала 1847 года действовало Кирилло-мефодиевское общество.

1848 год принес определенные изменения в общий характер деятельности органа «высшей» полиции. Революция в Западной Европе, оживление революционного движения в России, особенно в западных губерниях, требовали усиленного внимания со стороны правительства. Поэтому возрастает роль Ш отделения, а также его взаимодействие с министерствами (Иностранных Дел, МВД, Народного просвещения) для борьбы с «крамолой». 1848 год положил начало так называемой «эпохе цензурного террора».

Наряду с «оптимистическими выводами о «спокойствии» и «тишине» внутри страны Ш отделение в своих отчетах отмечало влияние революционных событий в Западной Европе в 1848-49 гг. на Россию. В качестве примера оно приводило ряд дел, которые стали предметом особого внимания тайной полиции: кружок Петрашевского, «мятежный заговор» в Вильно, «беспорядки» в училище правоведения и ряд других. Вся угроза обществу и трону была специально преувеличена: на деле это были кружки по интересам.

Наряду с решением «политических» задач, Ш отделение СЕИВК активно действовало как орган контроля и надзора за положением дел в системе государственного управления. Не стесненное никакими рамками, имея широкие полномочия как личный осведомительный орган императора, оно стало собирать обширную информацию о состоянии госучреждений, вмешиваясь в сферу деятельности министерств и ведомств в известной степени направляя политику правительства в нужное русло. Ш отделение практически вело наблюдение и представляло Николаю I сведения обо всех основных отраслях управления государством, начиная от Министерства Внутренних Дел и заканчивая духовным ведомством. В его отчетах содержались и характеристики деятельности различных министров и главноуправляющих. В одних случаях Ш отделение ограничивалось «дружескими советами и увещеваниями», в других – настаивало на принятии немедленных действия со стороны министерств и ведомств, в третьих – ходатайствовало перед императором о необходимости смены какого-нибудь должностного лица и т.п. Такая активная оценка являлась частью общего централизованного надзора.

Ш отделение вмешивалось не только в дела администрации, но и выполняло судебные функции, «подменяя» часто и Министерство юстиции, и правительствующие Сенат в решении особо важных политических и уголовных дел.

Всесторонний полицейский контроль и надзор осуществлялся непосредственно под руководством императора. «Высочайшие» резолюции предельно точно передают атмосферу личного участия Николая I в вопросах политической полиции, его постоянное стремление регулировать весь ход действий Ш отделения, не допуская возникновения относительно независимого органа полиции.

Такое управление «по личной воле и личным воззрениям», помимо установленных государственных учреждений, через собственную канцелярию, являлось одной их характерных черт николаевской монархии.

Одновременно с ростом значения канцелярии, каждое из отделений было связано с важнейшими отраслями управления, происходил процесс разложения Системы министерского управления и уменьшения влияния Государственного Совета и Комитета Министров.

Основные функции были возложены на Корпус жандармов – исполнительный орган полиции. Наиболее важную роль в нем играли губернские жандармские штаб-офицеры. Руководствуясь секретными Инструкциями, они практически не были ограничены в своих действиях. Информация, сообщаемая жандармами в Ш отделение, была обширна и многообразна. Она касалась различных сторон государственной и общественной жизни страны: политического, экономического состояния вверенных им губерний, описания «нравственного духа» всех сословий, хода рекрутских наборов, положения на ярмарках, результатов ведения следствий по делам о пожарах, о неповиновении и «буйстве» крестьян, о случаях жестокого обращения помещиков с крепостными, о дворянских выборах и деятельности губернских секретных комитетов по делам о раскольниках, о перемещениях иностранцев и действиях фальшивомонетчиков и, вообще, обо всех происшествиях в губерниях.

Характерной чертой нового органа политической полиции было то, что его структура и организация, начиная от подразделения на экспедиции и кончая образованием разветвленной сети жандармских округов, в целом оставались неизменными на протяжении последующих 80 лет. В то же время аппарат учреждения претерпевал определенные изменения в соответствии с возрастанием объема задач, стоявших перед органом полиции, с проникновением его во все новые сферы политической и общественной жизни страны.

Численность штата Ш отделения с 1826 г. по 1856 г. выросла с 16 чел. (11.860 руб./сер.) до 30 чел. (41.450 руб./сер.). Общее число чиновников равнялось 40-45 чел., а общие расходы по отделению составляли свыше 100 тыс.рублей.

Аппарат Ш отделения, являясь центром политической полиции в России, представлял собой сложный, взаимосвязанный механизм. Подразделенный на экспедиции по характеру рассматриваемых дел и непосредственно подчиненный управляющему отделением (а с 1839 г. начальнику Корпуса жандармов), он постоянно расширялся, приобретая формы бюрократического учреждения. Наиболее ответственная работа выполнялась под руководством Начальника отделения самим управляющим и его ближайшими помощниками. Это был основной стержень учреждения.

За первые 30 лет существования Ш отделения и Корпуса Жандармов сменилось: два начальника отделения – А.Х.Бенкендорф (25.06.1826 - 02.09.1844 гг.) и А.Ф.Орлов (17.09.1844 - 05.04.1856 гг.), а также три управляющих отделением М.Я.фон Фок (15.07.1826 – 27.08.1831 гг.), А.Н.Мордвинов (01.09.1831 – 18.03.1839 гг.) и Л.В.Дубельт (24.03.1839 – 29.06.1856 гг.).

После 1827 г. развитие Жандармской организации было подчинено двум основным моментам:

1. Дальнейшему объединению всех жандармских частей и окончательному подчинению их шефу жандармов.

2. Наиболее рациональному размещению жандармских частей и установлению такой системы, которая позволила бы на всей территории Российской Империи обеспечить контроль и наблюдение.

Практически это нашло выражение в образовании новых округов, управлений и команд, в увеличении общей численности жандармов. Этот процесс, происходивший в тесном взаимодействии с решением ряда политических и экономических задач, явился воплощением стремлений верховной власти дать исполнительному органу полиции постоянное и твердое образование.