· Осуществляют и совершают таможенный контроль и таможенное оформление, создают условия способствующие ускорению товарооборота через таможенную границу РФ;

· Ведут таможенную статистику внешней торговли и специальную таможенную статистику РФ;

· Ведут товарную номенклатуру внешнеэкономической деятельности;

· Содействуют развитию внешнеэкономических связей республик в составе РФ, автономной области, автономных округов, краёв, областей, городов Москвы и Санкт-Петербурга, а также предприятий, учреждений, организаций и граждан;

· Содействуют осуществлению мер по защите государственной безопасности, общественного порядка, нравственности населения, жизни и здоровья человека, защите животных и растений, охране окружающей природной среды, защите интересов российских потребителей ввозимых товаров;

· Осуществляют контроль за вывозом стратегических и других жизненно важных для интересов РФ материалов;

· Осуществляют валютный контроль в пределах своей компетенции;

· Обеспечивают выполнение международных обязательств РФ в части, касающейся таможенного дела; участвуют в разработке международных договоров РФ, затрагивающих таможенное дело; осуществляют сотрудничество с таможенными и иными компетентными органами иностранных государств, международными организациями, занимающимися вопросами таможенного дела;

· Проводят научно-исследовательские работы и консультирование в области таможенного дела; осуществляют подготовку, переподготовку и повышение квалификации специалистов в этой области для государственных органов, предприятий, учреждений и организаций;

· Обеспечивают в установленном порядке Президента РФ и Правительство РФ, иные государственные органы, предприятия, учреждения, организации и граждан информацией по таможенным вопросам;

· Реализуют единую финансово-хозяйственную политику, развивают материально-техническую и социальную базу таможенных органов, создают необходимые условия труда для работников этих органов.

Таможенные органы выполняют возложенные на них функции на единой правовой основе. ТК РФ и Закон РФ «О таможенном тарифе» являются единой базой всего механизма правового регулирования таможенных отношений, затрагивают все основные вопросы, возникающие в практической деятельности таможенных органов.

В системе таможенных органов функционируют таможенные лаборатории, научно-исследовательские учреждения, учебные заведения, вычислительные центры и другие предприятия, организации и учреждения, подведомственные ГТК России.

На предприятия, организации и учреждения системы таможенных органов полностью распространяется гражданское законодательство (ГК РФ, другие законы и нормативные акты),определяющее их правовое положение. Вместе с тем административно-правовой статус системы таможенных органов имеет особенности – они учреждены государством. Их имущество является федеральной собственностью. Правомочия собственника по управлению этим имуществом осуществляет ГТК России. На них не распространяется законодательство о приватизации.