Отделом были продолжены научные исследования по нормированию и разработке ПДК химических и биологических средств защиты растений и изучению влияния химических и биологических обработок пойменных лесов на водные биогеоценозы.

Кроме традиционных исследований, в число новых направлений научных поисков отдела вошли:

• Изучение дифференциальной диагностики пестицидной интоксикации ихтиофауны промысловых рыб Азовского бассейна.
• Разработка методических рекомендаций "Критериально-диагностический комплекс показателей оценки пестицидной интоксикации ихтиофауны".
• Разработка научно-обоснованного комплекса маркерных показателей для ранней диагностики пестицидной интоксикации гидробионтов. Научно обоснован комплекс критериально-диагностических показателей липидного обмена у предличинок осетровых рыб. Адаптирован и внедрен в практику токсикологических исследований метод количественного и качественного определения липидных фракций (эфиров холестерина, холестерина, фосфолипидов, триацилглицеридов, свободных жирных кислот) предличинок осетровых рыб.
• Изучение зависимости биологической активности пестицидов от их химического строения и физико-химических свойств, установление количественных закономерностей и разработка математических моделей прогноза токсичности пестицидов. Научно обоснован метод прогноза токсичности и опасности пестицидов для раннего онтогенеза осетровых рыб и беспозвоночных животных, основанный на ведущей роли транспортно-распределительных процессов в патогенезе пестицидной интоксикации, определяемой коэффициентом распределения октанол-вода. Разработка и внедрение в практику математических моделей прогноза токсикометрических параметров действующих веществ и препаративных форм пестицидов.
• Изучение мутагенных свойств пестицидов на основе применения анафазного метода учета хромосомных аберраций в эпителиальных клетках плавниковой каймы предличинок осетровых рыб.
• Изучение тератогенных свойств пестицидов, поиск специфических тератогенных эффектов, вызываемых различными химическими классами пестицидов с целью их использования в качестве биомаркеров при биотестировании природных загрязнений.
• Ведутся работы над созданием атласа патологий эмбрионального и раннего постэмбрионального развития осетровых рыб при пестицидной интоксикации.
• Поиск альтернативных тест-объектов для эмбрио- токсикологических исследований. Проводятся работы по адаптации бычка-кругляка к пресной воде в лабораторных условиях для дальнейшего использования его в качестве тест-объекта при проведении токсикологических экспериментов. Экспериментально определена тесная корреляционная связь чувствительности осетровых рыб с реактивностью бычка-кругляка и испапнского тритона на ранних этапах онтогенеза к пестицидной интоксикации.
• Усовершенствование методики разработки рыбохозяйственных нормативов по сокращенным и расчетным схемам (ОБУВ).
• Изучение токсикологического состояния промысловых рыб Азовского бассейна в зависимости от степени накопления пестицидов.
• Разработка рекомендаций по предотвращению пестицидного загрязнения водохранилищ.
• Проведение пересмотра эколого-рыбохозяйственных нормативов (ПДК) пестицидов для воды рыбохозяйственных водоемов.
• Обоснование регламентов применения пестицидов для рыбохозяйственных водоемов.
• Проведение научной экспертизы материалов по токсиколого-рыбохозяйственной характеристике пестицидов в соответствии с требованиями "Положения о регистрационных испытаниях и регистрации пестицидов в Российской Федерации" в части FI.
• Оценка функционального состояния промысловых рыб Азовского моря при пестицидной интоксикации.

В настоящее время отдел рыбохозяйственной токсикологии, возглавляемый к.б.н. О.А.Зинчук, состоит из двух лабораторий: лаб разработки ОБУВ и токсикометрии (рук., к.б.н. О.А.Зинчук), лаб. регламентации пестицидов (рук., к.б.н. Л.А.Бугаев) и сектора новых тест-объектов (рук., к.б.н. В.Ю.Шепило).

2.5 Отдел океанографии

В состав отдела входят 19 человек, специалистов в области изучения водных экосистем (гидрологи, океанологи, гидробиологи).

Отдел океанографии проводит изучение абиотических и биотических основ формирования экосистем водоемов Азово-Черноморского бассейна как среды обитания гидробионтов, в том числе промысловых рыб.

Основной метод исследования - сбор информации в комплексных экспедициях в режиме мониторинга с использованием стандартных методик, разрешенных в России для проведения экологических исследований.

Гидробиологические исследования включают изучение фитопланктона, зоопланктона, бактериопланктона, бактериобентоса и зообентоса. По результатам исследований разработаны базы данных, которые содержат научную информацию по основным биологическим параметрам и ежегодно пополняются. Данные биологических исследований используются для разработки экологических прогнозов, оценки трофологических основ формирования запасов рыб, определения эффективности использования биологических и кормовых ресурсов. Использование базы данных позволяет оценить экологический и рыбохозяйственный ущерб водным и биологическим ресурсам в связи с планированием и проведением хозяйственной деятельности.

Главной задачей сектора гидрологии является изучение климатических и антропогенных аспектов эволюции элементов гидрометеорологического режима Азовского и Черного морей, рек, водохранилищ и лиманов и других водных объектов как среды обитания гидробионтов. На основе постоянно пополняющейся базы данных по гидрометеорологическому режиму Азовского и северо-восточной части Черного морей исследуется пространственно-временная изменчивость абиотических характеристик экосистемы, выявляются причинно-следственные связи между элементами гидрологического режима бассейна Азовского и Черного морей, исследуются периодичность и цикличность в их многолетних колебаниях. Важной функцией сектора является разработка требований рыбного хозяйства к бассейновым водным ресурсам. В современный период интенсивного использования водных ресурсов и глобальных климатических изменений сотрудники сектора гидрологии занимаются разработкой рекомендаций по управлению элементами гидрологического режима экосистем Азовского и Черного морей, вопросами оптимизации водного режима применительно к требованиям рыбного хозяйства. Неотъемлемой частью исследований сектора гидрологии стала разработка долгосрочных и краткосрочных прогнозов гидрологического режима Азовского и Черного морей в рамках обеспечения прогнозных рыбопромысловых разработок института, а также оперативное обслуживание рыбной промышленности информацией по состоянию режима водных объектов бассейнов Азовского и Черного морей.