Ихтиофауна Байкала сложилась в результате разновременного проникновения в водоем рыб различных фаунистических комплексов и эволюции коренной фауны. В Байкале вместе с акклиматизантами насчитывается 54 вида и подвида рыб, относящихся к 15 семействам, 5 отрядам. Все рыбы Байкала принадлежат к трем группам (комплексам): сибирскому, сибирско-байкальскому и байкальскому.

Сибирский комплекс составляют общесибирские виды, обитающие в прибрежье, заливах и сорах Байкала. Их еще называют соровыми рыбами. Это в основном карповые, окуневые, щуковые. В эту группу входят и акклиматизированные виды - сазан, сом и лещ.

Сибирско-байкальский комплекс представлен хариусовыми, сиговыми и осетровыми, которые живут в прибрежной зоне озера до глубин 300 м и заходят в пелагиаль открытого Байкала в летне-осенний период.

Байкальский комплекс преобладает в озере - он составляет 56% от общего числа видов и 80% всей биомассы рыб. Комплекс представлен 29 видами подкаменщиковых, из которых 27 - эндемики. Эти виды живут в озере от уреза воды и до максимальных глубин. Прибрежные бычки-подкаменщики обитают совместно с представителями других комплексов и служат для них, с одной стороны, объектами питания, с другой - конкурентами в потреблении пищи

Состав ихтиофауны Байкала с учетом акклиматизированных видов /3/

Самые маленькие и большие рыбы Байкала.

Осетр байкальский, его длина достигает 1,5 – 1,8 м, а вес 100 – 130 кг и более. Второй по величине и весу – таймень. Его длина до 1 м, а вес до 40 – 50 кг. Широколобка Гурвича – самая маленькая рыбка в Байкале, вес взрослой особи всего 2 – 3 г.

Гольяны – самая распространенная рыба заливов Байкала. И лишь ничтожный размер этой рыбы является причиной того, что на нее нет до сих пор никакого промысла.

Самые плодовитые рыбы Байкала: налим и осетр. Самка налима весом около 4 кг откладывает до 2, 3 млн. икринок. Количество откладываемой икры осетра с возрастом самок увеличивается до 350 – 400 тыс. штук.

А вот самая многочисленная рыба Байкала – это большая и малая голомянка. Общая численность и биомасса в 2 раза больше, чем всех остальных рыб и составляет 150 – 170 тыс. тонн. Биомасса других рыб в Байкале 76 тыс. тонн.

Растительноядных рыб в Байкале, таких, для которых растительный корм является основным, нет. Некоторые виды прибрежных донных бычков – широколобок в незначительном количестве поедают водоросль – улотрикс, возможно также тетраспору. Водорослевые растения в летнее время поедает сорога.

Пелагические рыбы – рыбы, обитающие в верхних слоях открытой части Байкала, некоторые из них проводят вдали от берегов большую часть жизни, а приближаются к берегу только для откладывания икры. Омуль тоже относится к пелагическим рыбам, но живет в открытой части Байкала, когда там прогревается вода и появляется достаточное количество кормовых планктонных организмов. К собственно пелагическим рыбам можно отнести голомянок. Они живут в более глубоководных слоях и около дна, а у берега практически никогда не находятся, кроме случаев, когда после рождения личинок мертвые самки ветровыми течениями и волнами выбрасываются на берег. Из пелагических рыб в Байкале имеют промысловое значение: омуль, желто- и длиннокрылки. Пелагических рыб в открытом Байкале 5 видов. Другие предпочитают донные экотопы, прибрежные районы и заливы и встречаются в Байкале редко.