В соответствии с действующим законодательством внебюджетные фонды НИОКР формируются за счет добровольных отчислений в размере до 0,5% от валовой выручки, а РФТР - 25% от средств таких фондов. Кроме того, РФТР, финансирующий проведение НИОКР на возвратной основе, формирует свои ресурсы за счет средств, возвращаемых организациями-исполнителями НИОКР.

Федеральные отраслевые и межотраслевые внебюджетные фонды НИОКР должны стать важным инструментом накопления, распределения и направления денежных средств для проведения передовых прикладных научных исследований и разработок, при этом необходимо создать условия для активизации деятельности РФТР по оказанию на конкурсной основе финансовой поддержки инициативных проектов прикладных научных исследований и разработок межотраслевого характера, имеющих четко выраженную перспективу, возможность коммерциализации их результатов и соответствующих приоритетным направлениям развития науки и техники.

В связи с тем, что нормативная правовая база функционирования РФТР и системы внебюджетных фондов НИОКР была сформирована в середине 90-х годов прошлого века и в настоящее время устарела, для обеспечения динамичного развития и повышения результативности системы внебюджетных фондов НИОКР необходимо:

- снятие нормативных правовых ограничений на вложения фондом средств в организации инновационной инфраструктуры (технопарки, центры трансфера технологий и т.п.);

- смягчение или отмена требования об обязательной возвратности всех полученных от фонда средств в течение 3-х лет для расширения состава предлагаемых для поддержки проектов;

- придание РФТР статуса юридического лица для расширения возможностей реинвестирования возвратных средств и привлечения внебюджетных ресурсов;

- использования современных организационно-правовых форм РФТР; например, закрытого паевого инвестиционного фонда;

- передачи управления РФТР коммерческой организации, отобранной на конкурсной основе;

- привлечения наряду со средствами больших компаний частных инвестиций от компаний, не создающих собственные фонды технологического развития;

- формирование механизмов разделения коммерческих рисков между всеми субъектами реализации проектов, финансируемых с участием РФТР или внебюджетных фондов НИОКР.

В настоящее время отсутствуют фонды, обеспечивающие поддержку прикладных разработок, осуществляемых физическими лицами. Фонд содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере оказывает поддержку по проектам только юридических лиц в форме малых инновационных компаний. Для стимулирования изобретательства, развития кадровых ресурсов для инновационного бизнеса, формирования негосударственного научного сектора на основе наиболее эффективных творческих коллективов, вовлечения студентов в научную деятельность представляется целесообразным создать Фонд содействия изобретательству и научно-техническому творчеству. Деятельность данного фонда могла бы осуществляться в рамках двух основных программ:

- Поддержка изобретательства на основе предоставления грантов физическим лицам для проведения инициативных разработок и патентования соответствующих результатов, при этом преимущественно поддержка должна оказываться проектам с длительностью в несколько месяцев и стоимостью в пределах 50-150 тысяч. рублей (предполагается, что масштабы деятельности фонда по данной программе должны быть на уровне 3000-5000 проектов в год);

- Поддержка формирования негосударственных научных организаций на основе эффективных творческих коллективов путем предоставления ученым и студентам институциональных грантов, включающих финансирование расходов в 2 этапа: на проведение прикладных исследований и на создание в последующем научной фирмы для дальнейшего проведения исследований и разработок (поддержка может быть оказана по 100-200 проектов в год, при этом стоимость одного проекта, в среднем – 5-10 млн. руб.).

Поддержка инноваций. На настоящий момент с правовой точки зрения данная область является наиболее проработанной. Основными задачами в сфере поддержки инноваций и инновационного бизнеса применительно к деятельности фондов являются:

- Усиление поддержки высокотехнологичных компаний на ранних фазах инновационного цикла за счет расширения масштабов и ресурсной обеспеченности соответствующих направлений деятельности Фонда содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере, а также формирования специализированных посевных и стартовых фондов.

- Поддержка инновационных проектов в малом бизнесе, в том числе реализуемых в партнерстве с университетами, на основе расширения деятельности Фонда содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере, а также формирования и развития региональных паевых инвестиционных фондов.

- Стимулирование формирования частно-государственных региональных и отраслевых венчурных фондов, направленных на поддержку инновационных проектов высокотехнологичного среднего бизнеса, на основе их рекапитализации за счет средств Венчурного инновационного фонда, привлечения средств из бюджетов субъектов Российской Федерации, а также средств частных инвесторов, в том числе зарубежных.

- Обеспечение поддержки крупных многолетних инновационных проектов путем создания условий для синдицированных венчурных вложений, формирования крупных отраслевых венчурных фондов, а также на основе развития деятельности Инвестиционного фонда РФ.

- Содействие формированию и институциализации новых высокотехнологических компаний на базе существующих государственных научных организаций, отдельных структурных подразделений научных организаций, отдельных научно-технических проектов.

Принципиальное отличие «посевного» финансирования от венчурного - безвозмездность и направленность на финансирование разработки, находящейся в стадии незавершенной НИОКР. В настоящее время финансирование инновационных проектов, находящихся на начальной стадии развития (так называемое «посевное» финансирование) осуществляется Фондом содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере. Однако масштабы его деятельности в этом направлении не достаточны и не соответствуют инновационному потенциалу малого и среднего предпринимательства. Кроме того, именно при «посевном» финансировании важным становится региональное развитие соответствующей инфраструктуры. В этой связи речь может идти не только об увеличении ресурсов на «посевное» и стартовое финансирование в рамках деятельности Фонда содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере, но и о содействии формированию региональных посевных и стартовых фондов, в частности в рамках программы по поддержке малого предпринимательства. Для реализации данного направления необходима разработка развитой законодательной базы, регламентирующей деятельность посевных и стартовых фондов финансовой поддержки инновационных компаний на ранних стадиях развития.

Поддержка малых инновационных предприятий, реализующих проекты по разработке и освоению новых видов наукоемкой продукции и технологий, осуществляется Фондом содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере (ФСМП), образованный в соответствии с постановлением Правительства РФ от 3 февраля 1994 года №65. В настоящее время ФСМП имеет представительства в 25 регионах России. Важнейшими направлениями развития деятельности Фонда содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере в настоящее время стали: