Совет Федерации ратифицирует законодательные акты по вопросам развития рынка ценных бумаг. Государственная Дума разрабатывает законодательные акты по вопросам развития фондового рынка. Правительство РФ определяет общие направления, осуществляет руководство развитием рынка ценных бумаг через федеральные органы исполнительной власти, ведёт законодательную деятельность, осуществляя подготовку проектов указов и распоряжений Президента РФ, а также федеральных законов в области ценных бумаг, назначает и контролирует работу головных исполнителей по подготовке нормативных актов (Минфин, Мингосимущество, Минэкономики России и так далее).

Федеральная комиссия по рынку ценных бумаг (ФКЦБ), образованная Указом Президента РФ от 1 июля 1996 года, является федеральным органом исполнительной власти по проведению государственной политики в области рынка ценных бумаг, контролю за деятельностью профессиональных участников рынка ценных бумаг, обеспечению прав инвесторов, акционеров и вкладчиков. ФКЦБ России подчиняется непосредственно Президенту РФ. Она состоит из шести руководящих членов: руководителя ФКЦБ – председателя ФКЦБ, являющегося по должности федеральным министром, первого заместителя председателя, трёх заместителей председателя и секретаря. ФКЦБ разрабатывает концепцию развития фондового рынка, нормативно-правовые акты. Она принимает решения по вопросам регулирования рынка ценных бумаг, деятельности профессиональных участников рынка ценных бумаг, саморегулируемых организаций профессиональных участников рынка ценных бумаг и контроля за соблюдением законодательства Российской Федерации и нормативных актов о ценных бумагах.

ФКЦБ России издаёт распоряжения по вопросам выдачи, приостановления и аннулирования генеральных лицензий на осуществление лицензирования профессиональных участников рынка ценных бумаг, лицензий на осуществление профессиональной деятельности на рынке ценных бумаг и иных лицензий, а также по вопросам, имеющим распорядительный или индивидуальный характер, не требующим принятия постановлений в соответствии с федеральным законом. Распоряжения ФКЦБ России принимаются при согласии не менее половины её членов и подписываются председателем ФКЦБ России или его первым заместителем. Распоряжения ФКЦБ России подлежат опубликованию.[8]

Министерство финансов РФ осуществляет выпуск государственных ценных бумаг и общий контроль за развитием фондового рынка. В качестве эмитента государства Министерство финансов России разрабатывает цели и условия выпуска ценных бумаг, заключает договоры на первичное их размещение, оказывает организационно-техническое содействие в создании первичного и ликвидного вторичного рынков государственных долговых обязательств, создаёт систему льгот, обеспечивающих спрос на них, определяет цены первичного размещения. Минфин РФ: устанавливает правила совершения операций на рынке, учёта и отчётности по сделкам с фондовыми инструментами (для всех участников, за исключением банков, депозитариев, регистраторов, из сферы регулирования Минфина выведен также оборот валютных ценностей); аттестует специалистов на право ведения операций с ценными бумагами (за исключением персонала банков), контролирует использование квалификационных аттестатов, применяет санкции; регистрирует выпуски ценных бумаг (за исключением ценных бумаг банков и акций чековых инвестиционных фондов); регулирует совместно с Банком России выпуск и обращение государственных ценных бумаг; ведёт Единый государственный реестр зарегистрированных в РФ ценных бумаг (за исключением акций банков и чековых инвестиционных фондов) и обеспечивает его публикацию; контролирует приобретение крупных пакетов акций.

Центральный банк Российской Федерации является профессиональным участником рынка ценных бумаг, активно ведущим операции с ценными бумагами, а также государственным органом регулирования рынка. Он регулирует деятельность коммерческих банков и размещает на рынке государственные ценные бумаги. Вкладывая в государственные фондовые ценности собственные ресурсы, Банк России выступает в качестве дилера. Создавая вторичный рынок государственных ценных бумаг, этот банк выступает на нём в качестве финансового брокера, работающего по поручению Правительства. Он также выполняет функции депозитария, клирингового и расчётного центра по операциям с отдельными выпусками государственных ценных бумаг. Осуществляя кассовое исполнение государственного бюджета, Центральный банк выступает агентом по платежам, связанным с обслуживанием внутреннего государственного долга в форме ценных бумаг. Согласно Законам РФ «О Центральном банке Российской Федерации (Банке России)» и «О банках и банковской деятельности в Российской Федерации», Банк России на рынке ценных бумаг осуществляет: установление для банков правил совершения операций на рынке, учёта и отчётности по сделкам с фондовыми инструментами; регулирование и контроль операций банков с ценными бумагами; аттестацию специалистов банков на право ведения операций с ценными бумагами; регистрацию выпусков ценных бумаг банков; регулирование выпуска и обращения государственных ценных бумаг; ведение реестра ценных бумаг банков; регистрация и ведение реестра акционерных обществ – банков; подготовку специалистов по ценным бумагам. Кроме того, в соответствии с Законом РФ «О валютном регулировании и валютном контроле» от 14 июля 1992 года Банк России регулирует обращение ценных бумаг – валютных ценностей в части банковских и небанковских операций.

Министерство по управлению государственным имуществом осуществляет управление пакетами ценных бумаг, находящихся в собственности государства, в том числе золотыми акциями, дающими право вето на определённые решения акционерного общества. Мингосимущество РФ регулирует выпуск и обращение приватизационных чеков; устанавливает правила, регистрирует и контролирует преобразование государственных предприятий в акционерные общества при приватизации; осуществляет лицензирование, регулирование и контроль за деятельностью чековых инвестиционных фондов и аттестацию их специалистов; лицензирует, регулирует и контролирует управляющих чековыми инвестиционными фондами, регистрирует выпуск ценных бумаг чековых инвестиционных фондов; устанавливает правила учёта отчётности чековых инвестиционных фондов; ведёт разработку российской телекоммуникационной финансовой системы.

Совместно с Федеральной комиссией по рынку ценных бумаг Мингосимущество России определяет порядок создания и функционирования депозитариев и регистрационной сети, правил ведения реестров акционеров. Оно, также, регулирует порядок применения доверительной собственности, определяет содержание и порядок заключения трастовых договоров; осуществляет совместно с Министерством РФ по антимонопольной политике и поддержке предпринимательства регулирование, создание холдинговых компаний при преобразовании государственных предприятий в акционерные общества; регулирует операции с ценными бумагами подотчётного ему Российского фонда федерального имущества; определяет порядок операций с ценными бумагами при реорганизации или ликвидации предприятий по делам, находящимся в ведении Федерального управления по делам о несостоятельности (банкротстве).