Сальмонеллы часто встречаются у клинически здоро­вых сельскохозяйственных животных. Исследование больших групп крупного рогатого скота показало, что распространенность такой латентной инфекции в США составляет около 13%, в Голландии — около 14%. Носителями являлись также от 3,7 до 15% клинически здоровых овец. У свиней бессимптомные носители составляли 15—20% в Голландии, 7% во Франции, 12% в Анг­лии, 13,4% в Норвегии и 22% в Бельгии.

Наиболее часто от больных и от клинически здоровых сельскохозяйственных животных выделяются следующие 13 серотипов сальмонелл: S. typhimurium, S. derby, S. dublin, S. oranienburg, S. java, S. choleraesuis, S. anatum, S. newington, S. infantis, S. Stanley, S. abony, S. Chester, S. meleagridis. Среди людей описан ряд эпи­демических вспышек, вызванных 6 из перечисленных 13 серотипов. Специфичным для человека является вызыва­емый S. typhi брюшной тиф, который не встречается у животных.

Сальмонеллы часто обнаруживаются в загрязненных водах, включая сточные воды, буферные пруды, воды ирригационных систем, реки, ливневые стоки, приливную морскую воду. Пастбища, площадки для продажи скота, бойни могут высту­пать в роли основных источников сальмонелл, попада­ющих в реки и озера, используемые для рекреационных целей. На выживаемость в воде сальмонелл и бакте­рий —показателей фекального загрязнения — влияют одни и те же факторы. Сообщается о выделении сальмо­нелл из загрязненных рек. Например, из Ред Ривер (се­верная Дакота) они выделялись на расстоянии 35 км ниже по течению от выпусков сточных вод до наступле­ния сезона обработки сахарной свеклы. Однако с увели­чением переработки сахарной свеклы сточные воды, поступающие в реки в январе под ледяной покров, доста­вили большое количество питательных веществ, и саль­монеллы выделялись уже на расстоянии 118 км вниз по течению, или на расстоянии 4-суточного пути воды от ближайших источников загрязнения теплокровными жи­вотными.

В пробах воды из фермерских прудов при 21—29°С некоторые сальмонеллы выживали в течение 14—16 дней. При выдерживании в резервуарах в течение 20 дней летом или 60 дней зимой стоков с фермерских дворов была получена вода, не содержащая сальмонеллы («Sal­monella free»). Подобные же результаты были полу­чены при исследовании городских ливневых стоков. В пробах ливневых стоков, зараженных S. typhimurium и хранимых при 20°С, к 10-му дню отмечалась 99% ги­бель сальмонелл, при хранении при 10°С 5% клеток этого штамма выживали более 14 дней.

2.2 Шигеллез. Шигеллы вызывают дизентирию. Ею ежегодно болеют 500 млн человек. Она составляет 75% всех кишечных инфекций. Возбудитель выделяется из организма больного человека или носителя с содержимым кишечника. В США наиболее частой причиной ост­рых диарей являются шигеллы. Это заболевание эндемично в некоторых индейских резервациях и в горо­дах с низким социально-экономическим уровнем жизни. Исследования, проведенные в США за последние 5 лет (1964—1968), показали, что 2/3 из 45263 случаев заболе­вания были отмечены у детей до 10-летнего возраста. Средний процент бактериовыделителей шигелл сос­тавляет 0,46 в США, 0,33 в Англии и Уэльсе и 2,4 в типичных сельских местностях Шри Ланка. После клинического выздоровления человек может выде­лять шигеллы по крайней мере еще неделю, а в одном из обследований культура S. flexneri 2a была выделена от здорового носителя через 15 нед. Известно по край­ней мере 32 серотипа шигелл, из которых S. sonnei и под­группа S. flexneri составляют 90% всех серотипов, выде­ленных от людей. S. dysenteriae и S.boydii, составившие менее 1 % всех выделенных в США шигелл, чаще всего встречались у людей, посещавших другие страны.

Шигеллы редко встречаются у животных. По данным Национального центра по изучению инфекционных забо­леваний, за пятилетний период только 0,5% шигелл было выделено от животных. В основном это были нечеловеко­образные приматы, от которых шигеллез иногда переда­ется человеку.

Большинство эпидемий шигеллеза имеет пищевую этиологию или распространяется контактным путем. Однако значительное число эпидемий было вызвано питьевой водой низкого качества. Эти вспышки являлись, в частности, следствием аварий водоочистных систем, загрязнений колодцев паводковыми водами, слу­чайных перекрестных соединений канализационных труб с водопроводной.сетью, снабжением населения не­обработанной питьевой водой, а также следствием просачивания сточных вод в водопроводную сеть.

Хотя шигеллы и выделяются из различных загрязнен­ных вод, методы их обнаружения следует при­знать недостаточно чувствительными. Они имеют пока исключительно качественный характер и весьма трудо­емки. В результате шигеллы редко обнаруживаются в воде.

Выживаемость штаммов шигелл, выделяющихся из кишечника человека и поступающих в воду, определяет­ся многими экологическими факторами. Устойчивость шигелл, как и лептоспир и энтеровирусов, значительно выше в воде с низкой бактериальной обсемененностью. В чистых колодцах, умышленно зараженных шигеллами, эти микроорганизмы обнаруживались через 22 дня. В речной воде, искусственно зараженной шигеллами, они выживали в течение 4 дней. При аэрации проб речной воды время выживаемости шигелл снижа­лось до 30 мин. Культивирование в опытах in vitro при 37°С штаммов Klebsiella и колиформных организмов совместно с S. flexneri II вело к прекращению экспонен­циального роста последних в течение 12—15 ч. Высказы­вается предположение, что образование муравьиной и уксусной кислот колиформными организмами в смешан­ных культурах оказывало на штаммы шигелл влияние, варьирующее от бактериостатического до бактерицидно­го.

Другим важным фактором, влияющим на выживае­мость шигелл, является величина рН воды.

Температура воды также влияет на выживаемость шигелл: при низких температурах они выживают дольше. В Сибири длительный период низких температур (до —45°С) ведет к увеличению выживаемости шигелл в фе­калиях до 145 дней, в почве — до 135 дней и до 47 дней — в замерзшей реке. Хотя процессы естественного са­моочищения происходят даже в Арктике, в короткий летний период интенсивного солнечного освещения ско­рость естественного самоочищения является низкой и повторное фекальное загрязнение находящейся в состоя­нии вечной мерзлоты почвы вокруг населенных мест под­держивает резервуар шигелл и других патогенных мик­роорганизмов, которые могут рециркулировать через организм человека. При этом длительное замораживание не ведет к потере вирулентности патогенных микроорга­низмов, хотя при минусовых температурах и наблюдают­ся некоторые изменения биохимических свойств, усугубляющие трудности определения этих микроорганизмов лабораторными методами.

Вода устьев рек и ирригационные воды, стекающие в реки, содержат различные концентрации солей, кото­рые могут увеличивать сроки сохранения шигелл в воде. Хотя неочищенные сточные воды и не являются средой, благоприятной для шигелл, добавление в стоки NaCI или КС1 в концентрациях 0,035 М при рН 7,5 препятствует быстрому отмиранию S. flexneri II.

Важными факторами, влияющими на выживаемость шигелл в морской воде, являются состав микрофлоры и штаммовые различия этих микроорганизмов в устойчи­вости к естественной морской воде. Описан штамм ши­гелл, выживавший в ней в течение 70 дней, в то время как другие штаммы сохранялись только 15 дней.